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1974年5月，李政道携夫人第二次回国访问。基于当时中国理科教学中基础科学的训练大幅缩减的情况，李政道建议参照芭蕾舞剧团青年演员的培养模式，从农村和城市的学校，以全民性的方法推荐出很少数的、约十三四岁的且有培养条件的少年加以选拔，培养一支“少而精的基础科学工作队伍”。李政道关于建立“少年班”的建议得到了的首肯。1978年3月，中国科技大学成立了第一个“少年大学生集中培养基地”，即“少年班”。
1980年1月，李政道正式向中国政府提出CUSPEA（中美联合招考物理研究生计划）的招考计划，并付诸实施。CUSPEA培养了900余位博士研究生，为培养中国青年物理学家作出了贡献。此后他又倡导成立了中国博士后流动站和中国博士后科学基金会，并担任全国博士后管理委员会顾问和中国博士后科学基金会名誉理事长。他积极建议设立国家自然科学基金，并帮助提出具体实施方案，推动了中国科学基金制度的建立，对促进中国基础科学的发展产生了深远的影响。
